芍藥的果實為蓇葖，每個蓇葖含種子1～7粒。待種子成熟，蓇葖開裂，散出種子。各地果實成熟期不一，如黑龍江省牡丹江在9月上旬、山東荷澤在8月下旬、河南洛陽在8月上中旬、江蘇揚州在8月下旬前后。
種子宜采后即播，隨播種時間延遲，種子含水量降低，發芽率下降。種子有上、下胚軸雙重休眠特性，播種后秋天的土壤溫度使種子的下胚軸解除休眠狀態，胚根發育生根。當年生根情況愈好，則來年生長愈旺盛；若播種過遲，地溫不能解除下胚軸休眠，不能生很，則第二年春天發芽率大大降低。秋天播種生根后，經過冬天長時間的低溫，可解除上胚軸的休眠。翌年春天氣溫上升，濕度適宜時，胚芽出土。
芍藥種子的采收方法
當蓇葖果變黃時即可采收，過早種子不成熱，過晚種皮變黑、變硬不易出苗。果實成熟有早有晚，要分批采收，果皮開裂散出種子，即可播種，切勿曝曬種子，使種皮變硬，影響出苗。如果不能及時播種，可行沙藏保濕處理，但必須于種子發根前取出播種。
芍藥種子的播種時間
芍藥須當年采種即及時播種，如荷澤地區于8月下旬至9月下旬播種，若遲于9月下旬，則當年不能生根，次年春天發芽率會大大降低；而且，即使出苗，因幼苗根系不發達，難于抵抗春季的干旱，容易死亡。所以，荷澤幾次進行春播試驗，均告失敗。
芍藥種子的播種方法
1、種子處理：播種前，要將待播的種子除去癟粒和雜質，再用水選法去掉不充實的種子。芍藥種子種皮雖較牡丹薄，較易吸水萌芽，但播種前若行種子處理，則發芽更加整齊，發芽率大為提高，常達80%以上。方法是用50℃溫水浸種24小時，取出后即播。
2、整畦播種：播種育苗用地要施足底肥，深翻整平若土壤較為濕潤適于播種，可直接做畦播種；若墑情較差，應充分灌水，然后再做畦播種。畦寬約50厘米，畦間距離30厘米，種子按行距6厘米、粒距3厘米點播；若種子充足，可行撤播，粒距不小于3厘米；播后用濕土覆蓋，厚度約2厘米。每666.7平方米用種約50千克，撒播約100千克。播種后蓋上地膜，于次年春天萌芽出土后撤去。也可行條播，條距40厘米，粒距3厘米，覆土5～6厘米；或行穴播，穴距20～30厘米，每穴放種子4～5粒，播后堆土10～20厘米，以利防寒保墑。于次年春天萌芽前耙平。